449 ответов в теме

[Лабай А.А.]

Несмотря на причудливую форму дерева его структура довольно простая:

 

 

(https://photos.app.g...SQdx6yUCncxPCq9)

 

На рисунке мы видим «модальный» гаплотип, 29 современных «родственных» ему гаплотипов и две ветви, условно названные А и Б.

Теперь эту структуру немного "оживим".

[Лабай А.А.]

Прежде всего хочу отметить, что только девять человек «засветились»  в Y-ДНК проектах с гаплотипами (Y-12), идентичными «модальному» гаплотипу субклада T=L131.

 

Из них  только два гаплотипа имеют географическую привязку - №19 (Англия) и №211 (Соединённое Королевство). Правда сами носители скорее всего живут в США в штате Мичиган. К ним примыкают «анонимные» гаплотипы №№20,23,29,43 и 411. Все семь гаплотипов можно назвать «английскими». Гаплотип №860 можно добавить в эту компанию по следующим причинам. Во-первых, для него указаны имя и фамилия в английской традиции, во- вторых, он отличается в формате Y-67 от гаплотипа №211 всего на 2 мутации. Это явные родственники.

 

Девятый гаплотип №868 «анонимный», но в формате Y-37 он отличается от №860 тоже на 2 мутации.

 

Вполне возможно сделать вывод, что место «процветания» гаплотипа modal Т-L131 было, если не на Британских островах, то где-то в Северной Европе.

 

Все девять гаплотипов не тестировались на снипы. Но программа NEVGEN уверенно определяет снип L131, а у номеров 211 и 860 – даже CTS933.

 

Теперь переходим к оставшимся 20 гаплотипам, которые отличаются от гаплотипа modal только аллелями в локусе DYS385.

[Лабай А.А.]

Для сортировки гаплотипов по субкладам с целью ускорения процесса применялся формат Y-12.

Программа NEVGEN показывает очень хорошие результаты, но надо быть готовым к сюрпризам.

 

Так нетестированный гаплотип №602 из Туниса был отнесён предиктором с вероятностью 37% к ветви L131 и 33% к ветви L162. Как правило, больший процент указывает на верный снип. Но вчера прогнал через NEVGEN гаплотип №602 во всех доступных форматах. В результате получилось:

 

Y-12: L131>CTS933 (37%)

Y-25: L162          >> CTS11451> Y4119 (58%)

Y-37: L162          >> CTS11451> Y4119 (92%)

 

При отсутствии реального тестирования придётся признать, что тунисский гаплотип  имеет снип Y4119.

 

Такая же картина получилась и с гаплотипами из Ирана с номерами 716 и 904. Они отнесены по Y-37 к ветви Y11151 c вероятностью 100% для №904 и с вероятностью 99% для №716.

 

Напрашивается вывод, что «предковый» гаплотип возник ещё до разделения ветви M70 на субклады L131, L162 и Y11151.

 

Небольшая ремарка.

Точность предсказания NEVGEN не зависит от формата гаплотипа, а зависит от собранной статистики о соответствии аллелей STR   протестированным снипам. Порой «короткий» гаплотип даёт более верный ответ, чем «длинный». Но предсказание это слабая замена тестов.

[Лабай А.А.]

К проекту «Российская Империя» можно отнести пять гаплотипов:

 

№602 (Финляндия) DYS385 13-16.

№№ 1964,1982, 2012 (Украина) DYS385 14-16.

№2436 (Россия) DYS385 14-16.

 

Судя по информации о предках, носитель гаплотипа №602 проживал в Великом княжестве Финляндском, общий предок №№1964,1982, 2012 в Новороссийской губернии, а №2436 просто в Российской Империи.

 

По Y-12 финский гаплотип ближе к «модальному», чем восточноевропейские гаплотипы, являющиеся «родственниками» между собой, особенно 1964 и 2012 с идентичными Y-37.

 

По имеющимся предсказаниям и тестам финский гаплотип принадлежит к линии Т>>M70>L131>>S27463>Y174326, а восточноевропейские к линии Т>>M70>L131>>S27463>Y21210>Y21215.

 

Таким образом, генетические линии разошлись 4400-3100 лет назад.

 

Вопрос появления субклада L131 в Приазовье остаётся открытым, так как это могут быть потомки степных кочевников, балканцев и переселенцев из России. Для уточнения этого вопроса интересно было бы провести тестирование на терминальный снип гаплотипа №2436. Если это окажется CTS933 или S27463, то можно поставить на след из России.

Впрочем, посмотрим сначала на оставшиеся 12 гаплотипов.

 

Р.S. 30/07/23 исправлена опечатка в Y174326.

[Лабай А.А.]

С финским гаплотипом №602 в формате Y-12 совпадает 5 гаплотипов:

№41 (Италия)

№246 (Англия)

№319 (Хорватия)

№1075 (Аноним)

№2031 (Германия)

Предиктор уверенно сводит эти гаплотипы к субкладу CTS933, а вот глубже – сплошные сомнения, но в пределах Т>>M70>L131>> CTS933>>S27463>Y174326.

[Лабай А.А.]

Тесты сделаны для трёх гаплотипов:

№319 – L131

№602 – Y174326

№2031 - S27463

Для гаплотипов 246, 319, 602, 1075 и  2031 в формате Y-37 построим дерево:

 

 

(https://photos.app.g...s5b5QsXJPvidwa6)

Самая древняя линия сохранилась в Хорватии. Аноним и германский гаплотип различаются на 3 мутации – почти «родственники». Финский и английский – на 6 мутаций. Итальянский гаплотип Y-12 «болтается» где-то между ними.

Общий предок пяти гаплотипов жил примерно 3600-2600 лет назад, а общий предок 246, 319, 1075 и  2031 гаплотипов – 3000-2000 лет назад, возможно на Балканах.

 

[Лабай А.А.]

К восточноевропейским гаплотипам в формате Y-12 примыкает ещё три гаплотипа:

 

№87 (Германия)

№1806 (Ирак)

№2452 (Аноним)

 

Теперь восточноевропейская группа носителей гаплогруппы Т превращается в евроазиатскую – гаплотипы №№ 87, 1806, 1964, 1982, 2012, 2436 и 2452. 

 

Номера 1982 (Украина) и 2436 (Россия) представлены только форматом Y-12. Пожертвуем ими и построим дерево для 5 гаплотипов Y-37.

 

 

(https://photos.app.g...aJhoXUGwmT9dwr9)

 

[Лабай А.А.]

Есть ещё четыре гаплотипа, близкие к «предковому» гаплотипу. Это:

 

№27 в формате Y-12 из Мичигана с указанием на Англию. Предиктор относит его к T>>M70>L131>Y6033>Z19917>CTS933. У него DYS385= 13-18.

 

№130 в формате Y-67 из Мичигана, но без географической привязки. NEVGEN относит его  к ветви T>>M70>L131>Y6033>Z19917>CTS933, но DYS385= 14-17.

 

№2526 из Италии в формате Y-12. У носителя тестом подтвержден снип М70, а предиктор относит к T>>M70>L131. У гаплотипа DYS385= 14-17, что «роднит» его с №130.

 

Есть ещё один гаплотип - №943 в формате Y-37 c DYS385=13-13. Предиктор относит его к T>>M70>L131>> CTS933. Взят он из греческого проекта, но происхождение его неизвестно.

[Лабай А.А.]

 Новогодние чудеса начинаются. Сайт, таинственно исчезнувший в августе, в декабре неожиданно восстановился. Если в ближайшие часы он не исчезнет вновь, то можно будет продолжить тему.

[В.Юрковец]

Я, к сожалению, довольно неприятно переболел ковидом, со всеми положенными в моем случае последствиями . Совсем недавно почувствовал, что ситуация стала меняться и все идет к тому, что я, таки, глядишь, все-же выживу. Поживем - увидим, коллеги.