Перейти к содержимому

 

Фото

Маленькие Истории Рода Т


  • Чтобы отвечать, сперва войдите на форум
449 ответов в теме

#401 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 03 Июнь 2016 - 13:06

:D  Вы хозяин сайта - флаг вам в руки. Не скучайте!



#402 В.Юрковец

В.Юрковец

    Advanced Member

  • Administrators
  • 1 417 сообщений

Опубликовано 03 Июнь 2016 - 16:37

Никак, уходите? Жаль. Общий вектор нашего общения был весьма позитивным, несмотря на события последних дней.

 

Мы с Вами разобрались с экологией гаплогруппы Т, с тем, что в Махабхарате (индийской "Гигантомахии") удивительно точно описана современная модель оледенений Гросвальда, восстановили допотопный календарь и в каком-то разговоре даже нашли Бога.

 

Но потом что-то произошло и Вас увлекла идея "упразднить" ДНК-генеалогию в её сложившемся виде и изъять основополагающую роль Анатолия Алексеевича Клёсова в ней. Идея, мягко выражаясь, оригинальная, тем не менее Вам никто не мешал её развивать, пока Вы соблюдали рамки приличия, в первую очередь, по отношению к основателю ДНК-генеалогии, благодаря которому существует, в том числе, и этот сайт. Ну, а вчера Вас вообще занесло - никак иначе не могу назвать содержание Вашего сообщения, в которое кроме неправды, передёргивания и неслучайных умолчаний, Вы зачем-то притащили с молгена похабное определение события филогенеза, которое так нравилось тамошней либеральной околопопгенетической тусовке. От которой, тем не менее, они отказались после того, как я их пристыдил несколько лет назад. Что касается остального, то здесь Ваша проблема в том, что я в ДНК-генеалогии практически с самого начала (за пару-тройку лет до Вас) и у меня хорошая память на события.

 

И Вам не скучать.



#403 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 19 Июнь 2016 - 10:13

Если у кого есть вопросы - пишите V12189@mail.ru



#404 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 02 Июнь 2023 - 12:44

Недавно ко мне обратился "сосед" по гаплогруппе Т. В процессе общения я заглянул в эту забытую тему и обнаружил, что почти все иллюстрации канули в Лету. Вместе с тем, интерес к гаплогруппе Т сохраняется и, похоже, пришло время освежить информацию. В 2016 году у меня под рукой было 532 гаплотипа. Сейчас, на конец мая 2023г., мне удалось собрать 2617 разнокалиберных гаплотипов FTDNA, относящихся к гаплогруппе Т. Много это или мало? По экспертной оценке население планеты перевалило за 8.089.043.000 человек. Из них мужчин более 4.081.368.000. Можно предположить, что из них не менее 50.000.000 имеют гаплогруппу Т. Как видите, протестированных -  молекула в море. Но что выросло, то выросло. Как говорят, за неимением гербовой бумаги пишут на газетепростой.

Ныне живущие носители гаплогруппы Т это, выражаясь языком статистики, генеральная совокупность объектов (мужчин). Она подвижна во времени. Одни генеалогические линии гаплогруппы  вымирают, другие продолжаются, третьи возникают заново.

Моя база данных - случайная выборка, по которой я буду "ванговать", извините, буду судить о генеральной совокупности. Здесь надо помнить, что объем выборки влияет на уровень статистической значимости. Если взять слишком много народу, можно найти несуществующие различия, а если слишком мало — то «не заметить» имеющиеся. Первый случай нам не грозит, а вот о последствиях второго надо помнить всегда. Другими словами, на современном этапе тестирования Y-DNA  мы точно что-то упускаем. Но не будем о грустном, а перейдём к тому, что мы видим и предполагаем.



#405 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 05 Июнь 2023 - 12:50

Для начала заглянем на сайт Yfull. Группа исследователей считает, что гаплогруппа Т образовалась в период времени с 45500 по 39700 лет назад с вероятностью 95%.

Согласно парадигме палеоклиматологии это было время последнего оледенения, надвигавшегося с севера на Евразию и Америку (вюрмское в Альпах, вислинское в Зап.Европе, поозёрское в Белорусском Полесье, валдайское на Восточно-Европейской (Русской) равнине, зырянское на Западно-Сибирской равнине и т.д.).

Похолодание сопровождалось изменением растительных зон и поясов, что непосредственно влияло на изменение ареалов обитания животного мира (см. карту из Википедии):

florapo.jpg

 

 

Человек может обитать в любой зоне, если он имеет питьевую воду, растительную и животную пищу, комфортный тепловой режим.

С точки зрения археологии это был период перехода от мустьерской эпохи к верхнему палеолиту, характеризуемый ускорением темпов развития человеческого общества по всем направлениям (обработка камня, кости, изготовление одежды и украшений, строительство жилья, охота, погребения и искусство) в разных районах планеты.

Вполне разумно предположить, что климат был триггером, запустившим изменение человека.

Но что понимать под образованием гаплогруппы Т?



#406 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 06 Июнь 2023 - 22:45

Для начала вспомним, что «Т» в словосочетании «гаплогруппа Т» это просто буква латинского алфавита, которой исследователи начали маркировать группу мужчин, имеющих один общий SNP в Y-хромосоме.

До 2008 года гаплогруппа Т не выделялась, а была субкладом гаплогруппы К и обозначалась К2.

На самом деле, чтобы «записаться» в гаплогруппу надо иметь больше мутаций, чем одна, но обычно тестируют один SNP.

 

По версии Международного общества генетической генеалогии (ISOGG) история формирования «входного билета» в кладу Т выглядит так.

2006г.: 

K2 - M70, M184, M193, M272

 

2007г.:

K2- M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272

 

2008г.:

T - M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272   (formerly K2)

 

2009г.:

T - M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272

 

2010г.:

T - L206, M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272

 

2011г.:

 T - L206, L445, L452, L455, M184/Page34/USP9Y+3178, M193, M272, Page129

 

2012г.:

T - L445, L452, L455, L810, M184/Page34/USP9Y+3178, M272, Page129

 

2013 г.:

 T - L445, L452, L455/PF5670, L810, M184/Page34/USP9Y+3178, M272/PF5667, Page129

 

2014г.:

 T - M184/Page34/USP9Y+3178, CTS150, CTS482/PF5596, CTS493/PF5597, CTS573, CTS3585/PF5618, CTS3837, CTS4014, CTS4652/PF5547, CTS5035, CTS5268/PF7471, CTS5336/PF5626, CTS6045/PF5629, CTS6275/PF7447, CTS6887/PF5637, CTS7164, CTS7263, CTS7426, CTS7749/L810/PF5640, CTS8247, CTS8994, CTS10416/PF5655, CTS10700, CTS10879, CTS11569, CTS12657, L445, L452, L455/PF5670, M272/PF5667, Page129, PF5529, PF5537, PF5568, PF5587, PF5590, PF5603, PF5607, PF5613, PF5661, PF5674, PF5678, PF7460, PF7464, PF7466, PF7480

 

2015г.:

T-M184/Page34/USP9Y+3178, CTS150, CTS482/PF5596, CTS493/PF5597, CTS573, CTS3585/PF5618, CTS3837, CTS4014, CTS4652/PF5547, CTS5035, CTS5268/PF7471, CTS5336/PF5626, CTS6045/PF5629, CTS6275/PF7447, CTS6887/PF5637, CTS7164, CTS7263, CTS7426, CTS7749/L810/PF5640, CTS8247, CTS8994, CTS10416/PF5655, CTS10700, CTS10879, CTS11569, CTS12657, L445, L452, L455/PF5670, M193, M272/PF5667, Page129, PF5529, PF5537, PF5568, PF5587, PF5590, PF5603, PF5607, PF5613, PF5661, PF5674, PF5678, PF7460, PF7464, PF7466, PF7480

 

2016-2020гг.:

Т - M184/Page34/USP9Y+3178, CTS150, CTS482/PF5596, CTS493/PF5597, CTS549/L1322/PF5598, CTS573, CTS3585/PF5618, CTS3837, CTS4014, CTS4201/PF5621, CTS4652/PF5547, CTS5035, CTS5268/PF7471, CTS5336/PF5626, CTS6045/PF5629, CTS6275/PF7447, CTS6887/PF5637, CTS7164, CTS7263, CTS7426, CTS7749/L810/PF5640, CTS8247, CTS8994, CTS10416/PF5655, CTS10700, CTS10879, CTS11569, CTS12657, L445, L452, L455/PF5670, L692, M193, M272/PF5667, Page129, PF5529, PF5537, PF5568, PF5587, PF5589, PF5590, PF5603, PF5607, PF5609, PF5612, PF5613, PF5657, PF5661, PF5674, PF5678, PF7460, PF7464, PF7466, PF7480 

 

После 2020г. ISOGG перестала подавать признаки деятельности.

 

В базе тестов FTDNA чаще всего мы встречаем обозначение Т(условное обозначение гаплогруппы)-М70(тестовая мутация). По современным понятиям это один из субкладов гаплогруппы Т, наиболее многочисленный.



#407 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 07 Июнь 2023 - 21:56

В настоящее время реальную работу по созданию SNP-дерева ведет коллектив исследователей Yfull.

Сайт YFull (работает c 2012г.) выдаёт в этом году два варианта «входного билета» в кладу Т.

В одном месте:

 

Т- FGC1284/Y9169 * CTS8997/PF7476 * CTS4014+210 SNPs:

CTS8863 * CTS11569 * CTS3837 * M272/PF5667 * CTS2745 * CTS9566 * CTS9970/PF5653 * Y3778/FGC1237 * Y23350 * CTS4335 * FGC1222/Y9248 * CTS4014 * CTS4846/PF7470 * L452 * CTS5035 * CTS1440/PF5600 * PF5603 * Y3812/FGC1238 * CTS8864 * CTS150 * Y3807/Y3808/Y3809/Y125726 * FGC1284/Y9169 * S23125/FGC1289 * S14236/FGC1229 * PF7466 * PF7480 * Y3802/FGC1224 * Y3815/FGC1294 * CTS12657 * CTS7855 * CTS4652/PF5547 * CTS8857/PF5648 * CTS5336/PF5626 * CTS8533 * CTS12856 * CTS8997/PF7476 * CTS6045/PF5629 * FGC1273 * CTS7164 * CTS7263 * CTS8202/PF5643 * CTS8203/PF5644 * YP4764 * CTS11656 * CTS11626/PF5584 * CTS2460/PF5616 * CTS10416/PF5655 * CTS9400 * FGC1211(H) * FGC1286(H) * CTS11431(H) * CTS1599 * CTS9104/PF5559 * CTS9225 * FGC1205/Z19854/Y9246 * Y4022/FGC3949(H) * Y3820 * Y9262/FGC1180 * PF5607 * PF5613 * FGC1256/Y9237 * PF7464 * CTS12017/PF5672 * Y8775/FGC1520 * Y3819/FGC1247(H) * CTS7828 * CTS8051 * CTS8063 * CTS8095 * PF5661 * PF5674 * PF5678 * Y4025/FGC1275 * CTS4872 * FGC1251/Y9172 * CTS4831(H) * CTS5810 * FGC1221/Y9247 * CTS11121/PF5668 * BY1130/Y6053/A25766/Y3805 * FGC3950(H) * CTS9671 * CTS6120/PF5630(H) * CTS8898 * CTS6552 * CTS5499 * Y9258/FGC1234 * M184/PAGE34/USP9Y+3178/PAGES00034 * CTS7009 * Y9180 * FGC1230 * CTS11704 * CTS5198 * CTS4404 * Y3786/FGC1267(H) * S11664/FGC1219 * Y3862/FGC1269 * FGC1249/Y9233 * CTS9635/PF5562 * L455/PF5670 * CTS3801/PF5544 * PF5521(H) * FGC1518(H) * CTS8778 * CTS8669/PF5647 * PF5537(H) * PF5568 * PF5527 * PF5529 * FGC77744 * PAGE129/PAGES00129 * L810/CTS7749/PF5640 * CTS4435 * CTS4586/PF5623 * L1322/CTS549/PF5598 * L692 * CTS382 * CTS482/PF5596 * CTS866 * CTS12479 * CTS12967/PF5681 * CTS5091(H) * CTS5268/PF7471 * CTS5354 * CTS5667 * CTS6275/PF7447 * CTS6039 * CTS7664 * CTS7426 * CTS7560 * CTS8247 * CTS8453 * CTS8956 * CTS11212(H) * CTS10700 * CTS10825 * CTS10879 * PF5575(H) * PF5590 * CTS493/PF5597 * CTS573 * CTS793 * CTS1474/PF5601 * CTS11511/PF5582 * CTS465/PF5595 * Z7767/FGC1179 * S20955/FGC1235 * S8475/FGC1181 * FGC1192/Y9235(H) * FGC1517/Y9254(H) * FGC1184/Y9168(H) * FGC1185/Y9238 * FGC1187/Y9239 * FGC1258(H) * FGC1189/Y9251(H) * FGC1191/Y9240(H) * FGC1193/Y9252(H) * FGC1195/Y9243(H) * FGC1196/Y9241 * FGC1261(H) * FGC1199/Y9244(H) * FGC1201/Y9253(H) * FGC1202/Y9170(H) * FGC1264(H) * FGC1515/Y7379(H) * Y3776/FGC1213 * Y3791/FGC1215 * Y3777/FGC1276 * FGC1198/Y9261(H) * Y3811/FGC1288 * Y3800/FGC1285 * FGC1209(H) * FGC1262 * Y4986/FGC1287 * PF5609 * PF5605 * PF5589 * CTS6683(H) * Y3804/FGC1231 * PF5587(H) * CTS9703(H) * CTS9132/PF5650 * YP3792/FGC28017 * CTS6887/PF5637 * Y9257(H) * CTS2325(H) * CTS3864(H) * FGC1233/Y9171(H) * FGC1182/Y9165(H) * Y4985 * CTS8994 * CTS4201/PF5621 * FGC1255 * FGC1243/Y6045 * CTS3626 * FGC1292(H) * FGC1516 * FGC1188/Y9250(H) * Z13062/FGC22982 * CTS8385/PF5645 * PF7461(H) * FGC1290(H) * PF5657 * PF5612 * PF7460 * Y19379/BY1039 * Z19855/FGC1265(H) * Y19380/BY1038 * Y6054/FGC1514 * L445

 

В другом:

 

Т - Y23350 * Y3812/FGC1238 * L452+210 SNPs:

CTS7855 * CTS4652/PF5547 * CTS8202/PF5643 * CTS7263 * CTS7164 * CTS12657 * M272/PF5667 * CTS2886 * Y3802/FGC1224 * CTS2745 * CTS11569 * Y3796/FGC1218/SK1477 * CTS12856 * CTS6045/PF5629 * CTS5336/PF5626 * CTS5035 * CTS4335 * CTS8857/PF5648 * Y3815/FGC1294 * PF5603 * FGC1222/Y9248 * S14236/FGC1229 * S23125/FGC1289 * CTS1440/PF5600 * CTS8863 * CTS8203/PF5644 * CTS150 * CTS3837 * CTS8864 * CTS3585/PF5618 * FGC1273 * CTS8533 * CTS4846/PF7470 * PF7480 * PF7466 * Y3807/Y3808/Y3809/Y125726 * FGC1284/Y9169 * CTS8997/PF7476 * Y3778/FGC1237 * CTS4014 * CTS9970/PF5653 * CTS9566 * CTS4872 * FGC1251/Y9172 * CTS5810 * FGC1221/Y9247 * CTS8898 * CTS5499 * M184/PAGE34/USP9Y+3178/PAGES00034 * CTS7009 * Y9180 * FGC1230 * CTS11704 * CTS5198 * CTS4404 * FGC1249/Y9233 * CTS9635/PF5562 * PF5521(H) * CTS382 * CTS482/PF5596 * CTS866 * CTS8247 * CTS8453 * CTS8956 * CTS11212(H) * CTS493/PF5597 * CTS573 * CTS793 * CTS1474/PF5601 * S8475/FGC1181 * FGC1192/Y9235(H) * CTS10416/PF5655 * CTS11431(H) * Y4025/FGC1275 * FGC3950(H) * CTS9671 * CTS6120/PF5630(H) * CTS6552 * Y9258/FGC1234 * CTS3801/PF5544 * FGC1518(H) * PF5537(H) * PF5568 * PF5527 * PF5529 * FGC77744 * PAGE129/PAGES00129 * L810/CTS7749/PF5640 * CTS12479 * CTS7664 * CTS7426 * CTS7560 * CTS10700 * CTS10825 * CTS10879 * CTS11511/PF5582 * CTS465/PF5595 * FGC1517/Y9254(H) * FGC1184/Y9168(H) * FGC1185/Y9238 * FGC1187/Y9239 * FGC1258(H) * FGC1189/Y9251(H) * FGC1191/Y9240(H) * FGC1193/Y9252(H) * FGC1195/Y9243(H) * FGC1196/Y9241 * FGC1261(H) * FGC1199/Y9244(H) * FGC1201/Y9253(H) * FGC1202/Y9170(H) * FGC1264(H) * FGC1209(H) * FGC1262 * YP4764 * CTS1599 * FGC1205/Z19854/Y9246 * Y4022/FGC3949(H) * Y3820 * Y9262/FGC1180 * PF5607 * PF5613 * CTS12017/PF5672 * CTS7828 * CTS8051 * CTS8063 * CTS8095 * PF5661 * PF5674 * PF5678 * CTS4831(H) * CTS11121/PF5668 * BY1130/Y6053/A25766/Y3805 * Y3786/FGC1267(H) * S11664/FGC1219 * Y3862/FGC1269 * L455/PF5670 * CTS8778 * CTS8669/PF5647 * CTS4435 * CTS4586/PF5623 * L1322/CTS549/PF5598 * L692 * CTS12967/PF5681 * CTS5091(H) * CTS5268/PF7471 * CTS5354 * CTS5667 * CTS6275/PF7447 * CTS6039 * PF5575(H) * PF5590 * Z7767/FGC1179 * S20955/FGC1235 * FGC1515/Y7379(H) * Y3776/FGC1213 * Y3791/FGC1215 * Y3777/FGC1276 * FGC1198/Y9261(H) * Y3811/FGC1288 * Y3800/FGC1285 * CTS11656 * CTS11626/PF5584 * CTS2460/PF5616 * CTS9400 * FGC1211(H) * FGC1286(H) * CTS9104/PF5559 * CTS9225 * FGC1256/Y9237 * PF7464 * Y8775/FGC1520 * Y3819/FGC1247(H) * Y4985 * FGC1188/Y9250(H) * Y3804/FGC1231 * FGC1292(H) * FGC1255 * Y4986/FGC1287 * FGC1233/Y9171(H) * CTS9132/PF5650 * PF5587(H) * PF5589 * PF5605 * Y9257(H) * CTS4201/PF5621 * YP3792/FGC28017 * CTS6683(H) * FGC1516 * CTS3626 * CTS9703(H) * CTS8385/PF5645 * CTS8994 * CTS2325(H) * PF7461(H) * FGC1243/Y6045 * PF5609 * PF5657 * CTS3864(H) * CTS6887/PF5637 * FGC1182/Y9165(H) * Z13062/FGC22982 * FGC1290(H) * PF5612 * Y19380/BY1038 * Y19379/BY1039 * PF7460 * Z19855/FGC1265(H) * Y6054/FGC1514 * L445   

                

У этих перечней общими являются только 43 мутации.

Напомню, что количество мутаций непосредственно влияет на расчет времени образования гаплогруппы. Кроме того они указывают на количество потерянных генеалогических линий.



#408 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 08 Июнь 2023 - 21:02

Разнобой в определении номенклатуры SNP «входного билета» в гаплогруппу (не только Т) имеет следующую причину.

 

Размер Y-хромосомы порядка 60 млн. п.н.  Из них 95% составляют особые участки Y-ДНК. Раньше их называли нерекомбинирующим регионом Y-хромосомы (NRY). Некоторые исследователи даже употребляли прилагательное «никчемный». Изменения в NRY списывали исключительно на случайность. Ряд открытий показали, что это не совсем так и NRY стали именовать MSY (мужчино-специфический регион Y-хромосомы).

В настоящее время выявлено не менее 370541 генетических вариантов Y-хромосомы, обусловленными  инсерциями, делециями, инделами, заменами (subtitution), вариациями числа копий (SNV), инверсиями, трнаслокациями и, в том числе, однонуклеотидными полиморфизмами (SNP), которых в «мужской» хромосоме уже выявлено не менее 100000.

 

Таким образом, для объективной классификации необходимо у каждого мужчины проверять на положительный тест хотя бы на 100000 SNP. Или проверить выборку из 384 человек специально подобранных из разных регионов мира. По разным причинам это несбыточная мечта.

 

Принцип подсчёта Yfull времени образования гаплогруппы описан в «Константа скорости SNP мутаций Y-хромосомы по данным полного секвенирования» (Адамов и др., 2015).

 

.Поэтому будем опираться на данные Yfull, но периодически посматривать по сторонам. Вдруг обнаружат древнюю ДНК гаплогруппы Т пятидесятитысячной давности и мы узнаем предковый набор SNP.



#409 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 10 Июнь 2023 - 00:56

Обнаружив группу мужчин с одинаковым набором SNP, исследователи Y-ДНК делают обоснованный вывод, что гаплогруппа имела общего предка, но какая из 213 мутаций (для гаплогруппы Т) была первой - нам не известно. Впрочем это уже не важно, так как 212 генетических линий исчезли или ещё не найдены. Осталась только одна. Простая арифметика показывает, что в кладе Т примерно раз в 200 лет появлялся один устойчивый однонуклеотидный полиморфизм и исчезала одна генеалогическая линия. В настоящее время просматривается три линии. Одна (базовая Т) на положении исчезнувшей линии. Вторая (Т-PH196) – почти исчезнувшей, а третья (Т-L206) на положении доминирующей. В свою очередь в ней наблюдается аналогичная картина. Две линии (Т-L206 и Т-Y91161) исчезают, а линия T-M70 доминирует. Картина не меняется на протяжении последних 15 лет, но надо помнить, что мы практически ничего не знаем об мужчинах  гаплогруппы Т из африканских областей южнее Сахары, кроме того, что они там есть.



#410 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 10 Июнь 2023 - 23:54

Теперь вспомним, какие есть особенности наследования Y-хромосомы.

1. Y-хромосома наследуется от отца к сыну, за исключением случаев патологии.

2. Эффективный размер популяции (т.е. среднее количество особей в популяции, генный вклад которых обеспечивает её успешное размножение и выживание)  Y-хромосомы в четыре раза меньше, чем для аутосом; в три раза меньше, чем для X-хромосомы, и сопоставим только с мтДНК.

3.Y-хромосома предрасположена случайным изменениям частот аллелей и генотипов, происходящих в небольших полиморфных популяциях при смене поколений (т.е. генетическому дрейфу).

4. Y-хромосома проявляет очень низкий уровень генетического разнообразия по сравнению с остальной частью ядерного генома. Из-за этого Y-хромосома сильно восприимчива к генетическому дрейфу и эффекту основателя. Причем, дрейф ускоряет дифференциацию популяции и вызывает быстрое изменение частот гаплотипов во времени.

5. Межпопуляционное разнообразие Y-хромосомы много выше, чем других генетических систем, что обусловлено преобладающей в большинстве популяций патрилокальностью.

Эти особенности позволяют правильно оценивать имеющиеся в нашем распоряжении выборки тестов на SNP и STR.



#411 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 12 Июнь 2023 - 10:09

Подведем небольшой итог.

1. У отца рождается сын, который наследует отцовскую хромосому с одной мутацией (SNP), т.е. сын «выпал» из гаплогруппы отца.

2. Все мужские потомки этого сына образуют единую гаплогруппу, отличную от гаплогруппы отца их предка.

3. Гаплогруппа отца и гаплогруппа сына являются родственными и составляют одну семью.

4. Одновременно сын наследует от отца неизменный или измененый на одну мутацию STR гаплотип, кторый аналогично передается и потомкам сына.

5. Таким образом, в разных, но родственных гаплогруппах могут наблюдаться одинаковые 9или родственные) гаплотипы.

Теперь можно перейти к собранным FTDNA гаплотипам гаплогруппы Т.



#412 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 15 Июнь 2023 - 11:23

Среди 2618 гаплотипов клады Т как минимум 252 можно объединить в проект "Российская Империя". Результат выглядит так:

 

rossimp_-iiun23_2534384185.jpg

 

Это неукоренённое дерево Y-12 гаплотипов людей, построенное методом Neighbor-Joining.

Неукоренённое дерево не содержит корня и отражает связь листьев (гаплотипов) без предполагаемого положения общего предка.

Для ориентирования в группу введен гаплотип modal, в котором каждый маркер представлен модой. Этот расчётный гаплотип - апроксимация предкового гаплотипа. 

Таким образом, получаем возможность оценивать положение всех листьев относительно "предка".

Так как метод Neighbor-Joining не предполагает введения "молекулярных часов" попробуем оценить время жизни этого условного предка.

 

 

P.S. Так как срок  размещения (хранения) графических файлов на бесплатном сервисе для размещения (хранения) и публикации графических файлов ограничен, то размещаю более надёжную ссылку https://photos.app.g...oJvHsi6RUBkKag7.

 

  



#413 В.Юрковец

В.Юрковец

    Advanced Member

  • Administrators
  • 1 417 сообщений

Опубликовано 15 Июнь 2023 - 23:06

-Как вы тут без меня жили-нежили?

 

-Рад вас слышать! Жду Вас в личке, Валерий Павлович!



#414 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 16 Июнь 2023 - 15:03

 Программа NEVGEN (Y-ДНК предсказатель гаплогруппы) надёжно относит модальный гаплотип к гаплогруппе Т. 

При этом создатель программы на 83% уверен, что "предок" имел снипы CTS11451>Y4119.

YFull относит образование этих субкладов в период 9500-7500 лет назад, что соответствует 8-6 тыс. до н.э. или через 36 000 лет после образования гаплогруппы Т.

Кроме того на 35% (скорее нет, чем да) программа предполагает наличие снипа FGC80981 или на 18% наличие снипа Y4963. Оба снипа возникли в период  5000-3700 лет назад.

Если не привередничать, то мы имеем диапазон 9500-3700 лет назад.

Расчёт линейным методом времени жизни общего предка 253 обсуждаемых гаплотипов даёт период 8100-4400 тысяч лет назад.

Как видим, снипы и гаплотипы дают схожую картину.

Возникает вопрос : сохранился ли этот "предковый" гаплотип до настоящего времени?

Ответ: да !



#415 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 17 Июнь 2023 - 13:12

Внимательно посмотрим на область гаплотипа modal.

rosimp_1_0623.jpg

 

 

 

(https://photos.app.g...Jgj4VHjXBpLJft6)

 

Звездочкой обозначено место, где должны сходиться гаплотипы, неотличимые от «предкового». Таких мы видим два – 49 и 169.

Первый географически привязан к польскому Козинцу (Kozienice), а второй к Нижегородской области России.

Кроме них были найдены ещё четыре гаплотипа: один из Франции, один неизвестный, один из Саудовской Аравии и один из Объединённых Арабских Эмиратов.

География впечатляет:

rosimp_2_0623.jpg

 

 

(https://photos.app.g...wAoB7eeSEgSiUR6)

 

Посмотрим, что из этого можно выжать.



#416 В.Юрковец

В.Юрковец

    Advanced Member

  • Administrators
  • 1 417 сообщений

Опубликовано 18 Июнь 2023 - 00:29

К СОЖАЛЕНИЮ ФОРУМ МЕНЯ ПОКА ПЛОХО СЛУШАЕТ, НАДО ЗАНОВО УЧИТЬСЯ. НАПРИМЕР, НЕ МОГУ МЕНЯТЬ СТРОЧНЫЕ И ПРОПИСНЫЕ БУКВЫ В ТЕКСТЕ, МОЖЕТ, ПОДСКАЖЕТЕ7



#417 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 19 Июнь 2023 - 00:54

Нажмите Caps Lock (на клавиатуре в правом верхнем углу загориться светодиод) - будут печататься прописные. Если нажать ещё раз - строчные.



#418 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 19 Июнь 2023 - 01:00

Вернёмся к программе NEVGEN и прогоним через неё шесть гаплотипов рассматриваемой «предковой группы».
Забегая вперёд, распишу выявленное дерево SNP и выделю цветом те снипы, которые определит программа.
 
a) Т-Y3815>>L206>M70>:
 
b ) 1.>L131 >Y6033>Z19917>CTS933
 
c) 2.> Y11151
 
d) 3.>L162>L208>CTS11451>Y4119>CTS2214>:
 
e) 3.1>Y15127>Y3781
 
f) 3.2>Z709>CTS7703>Z710>L906>Y4984>P77>L907>Y4964>:
 
g) 3.2.1 >Y29991
 
 h) 3.2.2 >Y4956>CTS6507>:
 
i) 3.2.2.1>FGC80981
 
j)3.2.2.2>Y4963>CTS9882>Y4981>Y4958>>Y5676>Y5674>FGC4047>Y5685>Y8852>BY28603
 
Теперь можно перейти непосредственно к гаплотипам.



#419 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 20 Июнь 2023 - 12:10

У нас есть два Y-12 гаплотипа (Неизвестный и Саудовская Аравия), неотличимые от «предкового» гаплотипа. Программа выдает следующие результаты :

 

Неизвестный субклад – 11,58%

Т -L131 – 0,46%

T- CTS933 – 0,16%

T- Y11151 - 0,46%

T -Y4119 – 29,32%

Т- FT376050 -0,07%

T Y3781 -  2,21%

Т- Y29991 – 2,53%

Т- FGC80981 – 35,06%

Т- Y4963 – 18,12%

T- Y16897 – 0,01%

 

Несмотря на «аптечную» точность цифр, мы получили скромный результат. Тесты на снипы не проводились, но более-менее точно (88,4%) можно утверждать, что гаплотипы принадлежат ветке Т-Y3815>L206>M70. Другие варинаты не дотягивают до «спасительных» 51% - скорее «да», чем «нет». В качестве рабочей гипотезы остановимся на Т- FGC80981 (35,06%).

Возможно другие гаплотипы внесут больше ясности.



#420 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 794 сообщений

Опубликовано 20 Июнь 2023 - 13:03

Поместим в предиктор гаплогруппы нижегородский гаплотип. Программа показывает другую картину:

1.Неизвестный субклад – 55,81%

2.Т-L131 – 40,91%

Этот гаплотип по законам теории вероятности мы должны отнести или к гаплогруппе L или  даже LT. Другими словами, он более предковый, чем предыдущие два гаплотипа. Такой поворот обусловлен маркером DYS385. Но об этом позже, а сейчас перейдём к четвёртому гаплотипу – французскому.






0 пользователей читают эту тему

0 пользователей, 0 гостей, 0 скрытых

Copyright © 2024 Академия ДНК-генеалогии. Климатический филиал