Перейти к содержимому

 

Нравится больше всего


#573 Школа Днк-Генеалогии

Автор: В.Юрковец на 19 Октябрь 2013 - 23:16

Во 2-м номере "Вестника Академии ДНК-генеалогии" за этот год опубликована хорошая статья "Как вырастить своё древо?", в которой на примере своей гаплогруппы и личного опыта пошагово рассматривается все детали построения филогенетических деревьев. Автор - Лабай Александр Анатольевич. Статью можно найти, скачав Вестник т. 6 № 2 в разделе "Вестник".

 

Статья ещё хороша тем, что в ней изложены основные положения и последовательность практических действий для тех, кто решил узнать свою гаплогруппу и углубиться в изучение своего рода с помощью ДНК-генеалогии. Т.е. - полезна для всех новичков. Поэтому она размещена здесь (в содержательной своей части) и далее будет дополнена другими учебными материалами по данной теме.

 

 

 

ШКОЛА ДНК-ГЕНЕАЛОГИИ

THE DNA GENEALOGY SCHOOL

Как «вырастить» своё дерево

А.А. Лабай

 

ШАГ ПЕРВЫЙ

 

Открывать удивительный мир ДНК-генеалогии лучше всего с себя. Многие уже знают, что документальная генеалогия даёт сведения не ранее середины 19 века. Если повезёт до 18 века или, при самом удачном раскладе, до 17-16 веков. А если хочется заглянуть ещё дальше? Тогда вам надо сделать первый шаг - узнать свой гаплотип. Для этого надо связаться с лабораторией, делающей анализ некоторых участков Y-хромосомы, которые в ДНК-генеалогии называются маркерами. Например, с американской лабораторией FTDNA (Family Tree DNA), занимающей сегодня лидирующие позиции в этой области (http://www.familytreedna.com/).

...

Здесь надо сделать маленькое отступление. Дело в том, что маркеры, о которых говорилось выше, передаются по наследству только от отца к сыну и не передаются дочерям. И если у женской половины возникают вопросы о роде отца, то приходится брать пробы у отца, или у брата или у родного дяди. Мужчина может брать пробу у себя или у другого родственника по мужской отцовской линии. После запечатывания аппликаторов в индивидуальные упаковки, переходим ко второму шагу.

 

ШАГ ВТОРОЙ

 

Наступает  время определиться, что вам надо получить от ваших проб. Для новичка вопрос сложный и попробую его разъяснить с позиций того опыта, который я приобрёл за полтора года изучения ДНК-генеалогии.

Во-первых, чем больше вы хотите извлечь информации, тем дороже такой анализ стоит.

Во-вторых, «скупой» платит дважды.

Самый дешёвый анализ (стоит 2000 руб., не считая стоимости набора для проб) это определение вашей гаплогруппы. Это прямая дорога в страну с названием «Популяционная генетика» с её феерическими картами (пример на рис.1), которые гипнотизируют людей не хуже чем взгляд удава зазевавшегося кролика.

В России наиболее вероятны (в %) гаплогруппы:

I1 – 5%

I2a-10.5%

R1a-46 %

R1b-6%

G-1%

J2-3%

E1b1b - 2.5%

Т-1.5%

Q-1.5%

N-23%

В других странах (популяциях) соотношения могут быть другими (см. http://www.eupedia.c...plogroups.shtml) . Рассматривая популяционные карты и цифры, мы видим современное распределение представителей тех или иных гаплогрупп по странам и регионам. Если вспомнить, что гаплогруппа передаётся по наследству от отца к сыну, то за термином «гаплогруппа» можно закрепить такое понятие как Клан (по мужской линии). Здесь главное понять, что общий предок этого Клана жил десятки тысяч лет назад. Таких Кланов сейчас насчитывают двадцать и обозначают заглавными латинскими буквами от А до Т.  Глубинного смысла в этих буквах нет. Просто за ними скрывается информация, заложенная в Y-хромосоме (определённый однонуклеотидный полиформизм или SNP(англ.)) и передающаяся от отца к сыну. Как вы уже, наверное, заметили, к некоторым заглавным буквам присоединены цифры и маленькие буквы. Это означает, что внутри Клана можно надёжно лабораторными методами зафиксировать расхождение клана на ветви. Например, клан R  давным-давно разделился на R1 и R2. А R1, в свою очередь в какой-то момент времени, разошёлся на R1a и R1b.  Такие ветви в ДНК-генеалогии принято называть РодАми (по мужской линии). Различие между ними - в списке имеющихся SNP (см. дерево SNP по версии International Society of Genetic Genealogy -httpwww.isogg.org/tree/). Заплатив 2500 руб. вы получите знание о принадлежности к какому-то клану или даже роду. Но для более подробной классификации и привязки к дереву SNP вам придётся дозаказывать исследования по целому ряду SNP. При этом ваша индивидуальность будет растворена в популяции, группе с одним и тем же набором SNP.

Более дорогие анализы позволят вам узнать о своём гаплотипе, характеристике более индивидуальной и позволяющей не только косвенно судить о гаплогруппе, но и искать родственников по мужской линии по всему миру и считать время жизни общего предка родственной группы конкретных людей. Стоимость определения гаплотипа зависит от количества маркеров, которые подлежат анализу. Так например 12-маркерный гаплотип стоит 2400 руб., а 67-маркерный гаплотип – 10700 руб. (стоимость не включает стоимости набора для взятия проб).  По своему опыту могу сказать, что заказывать надо 67-маркерный гаплотип, который позволяет проводить детальные генеалогические исследования с высокой точностью.  Сейчас определяют и 111-маркерные гаплотипы, но не всем они доступны, да и в базах данных их немного. При необходимости можно будет дополнительно заказать исследование остальных маркеров. Но повторяю, что для первых шагов в ДНК-генеалогии лучше знать на сегодняшний день свой 67-маркерный гаплотип. Кроме того, в анализ входит определение гаплогруппы.  Указывайте необходимый анализ в сопроводительном документе и смело отправляйте свои анализы заказным (обязательно) письмом по указанному адресу. Вот алгоритм действий для тех, кто решился определить свой гаплотип, а не ограничился гаплогруппой:

1. Отслеживайте путь заказного письма на сайте «Почта России».

2. Как только письмо прибудет в конечную точку, звоните (или пишите) в ЗАО «Родство» и предупредите сотрудника.

3. Убедитесь, что письмо получено.

4. После этого ждите сообщения о том, что письмо передано в лабораторию FTDNA. Как только окажется, что ваши пробы пригодны для анализа, вам надо будет оплатить анализ.

5. После оплаты вам  сообщат логин (это номер вашего KIT) и пароль, по которому вы сможете зайти в личный кабинет на сайте FTDNA и отслеживать результаты.

 

ШАГ ТРЕТИЙ

 

Наступает период длительного ожидания. Мой совет - не тратьте время на болтовню. У вас ещё будет масса времени делать сногосшибательные «открытия», какая гаплогруппа «круче» и «кто кого заборет».  Лучше откройте статью А. Клёсова «ДНК-генеалогия. О чем эта наука, что она определяет и выявляет, и кому она интересна». Найти её можно в «Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии. Том 4, № 11, ноябрь 2011» (см.http://aklyosov.home...ex.html#vestnik). Начинайте читать и вникать. Много будет непонятно. Не стесняйтесь и задавайте вопросы в разделе «Практическая ДНК-генеалогия» на форуме «Родство». Вам всегда помогут разобраться и подскажут.

 

ШАГ ЧЕТВЁРТЫЙ

 

И вот, наконец-то, вы становитесь обладателем шестидесяти семи заветных цифр  и гаплогруппы. Это ваша модель, ваш представитель в мире ДНК-генеалогии.

Вот, например, мой 67-маркерный гаплотип из клана T1(M-70):13 23 14 10 15 16 11 12 12 12 13 29 -- 18 9 9 11 13 26 14 19 33 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 16 14 17 16 37 39 12 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 11 11 13 11 11 9 11

Цифры записаны в определённом порядке, установленном FTDNA. Первые 12 цифр (до двойного дефиса) соответствуют 12 маркерам с названиями:

DYS393-DYS390-DYS19-DYS391-DYS385a-DYS385b-DYS426-DYS388-DYS439- DYS389i- DYS392- DYS389ii. Это первая панель гаплотипа. Как раз за неё предлагалось заплатить 2400 руб.

Вторую панель гаплотипа составляют маркеры:

DYS458-DYS459i-DYS459ii-DYS455-DYS454-DYS447-DYS437-DYS448-DYS449-DYS464a-DYS464b-DYS464c-DYS464d (до второго двойного дефиса).

Если их добавить к первой панели, то это будет 25-маркерный гаплотип FTDNA.

Третью панель образуют маркеры:

DYS460-(Y-GATA-H4)-YCAIIa-YCAIIb-DYS456-DYS607-DYS576-DYS570-CDYa-CDYb-DYS442-DYS438.

Вместе с первой и второй панелью она составляет 37-маркерный гаплотип FTDNA.

В четвёртой панели ещё тридцать маркеров:

DYS531-DYS578-DYF395S1a-DYF395S1b-DYS590-DYS537-DYS641-DYS472-DYF406S1-DYS511-DYS425-DYS413a-DYS413b-DYS557-DYS594-DYS436-DYS490-DYS534-DYS450-DYS444-DYS481-DYS520-DYS446-DYS617-DYS568-DYS487-DYS572-DYS640-DYS492-DYS565.

Если её добавить к трём первым, то имеем 67-маркерный гаплотип FTDNA.

Если вы сталкиваетесь с какой-то записью гаплотипов, то в первую очередь надо узнать, в какой последовательности расставлены маркеры. И записать в такой же последовательности цифры, соответствующие этим маркерам, из своего гаплотипа.

Так, например, А. Клёсов ввел понятие 22-маркерного «медленного» гаплотипа, который состоит из маркеров :

DYS426-DYS388-DYS392/DYS455-DYS454/DYS438/DYS531-DYS578-DYF395S1a-DYF395S1b-DYS590-DYS641-DYS472-DYS425-DYS594-DYS436-DYS490-DYS450- DYS617-DYS568-DYS640-DYS492.

Здесь косой чертой обозначены панели маркеров. Я беру значения этих маркеров (выделены жирным в моем 67-маркерном гаплотипе выше) и записываю в том же порядке, в котором следуют маркеры:

11 12 13 --11 13 -- 9 -- 11 8 16 17 8 10 8 11 10 12 12 8 11 11 11 9

Более подробно о  22 маркерных гаплотипах можно прочитать в статье А. Клёсова «Расчеты численных значений констант скоростей мутаций самых медленных 22 маркеров 67-маркерной панели» (Вестник Академии ДНК-генеалогии, том 4, номер 5, май 2011).

Теперь самое время запомнить одну истину. ДНК-генеалогия это не генетика. Вас не должно волновать, почему маркеры называются так, а не иначе; в каком месте Y-хромосомы располагаются эти маркеры и что означают цифры, соответствующие этим маркерам. На первом этапе довольствуйтесь тем, что вам из лаборатории прислали цифровую модель вашей личности. Эти знания будут приходить постепенно, по мере освоения методологии ДНК-генеалогии.

 

ШАГ ПЯТЫЙ

 

Когда проходит  первая радость от обладания такими сокровенными знаниями, то возникает извечный вопрос: «Что делать?».Ответ простой – искать место, где собрались цифровые модели реальных людей. Это различные базы гаплотипов разных коммерческих и научных организаций. Одна из мощных баз – это база FTDNA. Вот один из способов найти представителей своего клана. Как я говорил, в результате проведённого анализа моей Y-хромосомы, мне сообщили гаплогруппу Т1 (М-70).

 Захожу по ссылке http://www.isogg.org/tree/ на сайт Международной организации генетической генеалогии. В строке «Haplogroups:» нажимаю на кнопку T и попадаю на страницу гаплогруппы Т и её субкладов. Учитывая, что я уже знаю о наличии SNP под названием М-41470, то вижу, что как минимум  мой род – Т1а. Чтобы углубиться, надо делать дополнительные тесты на наличие нисходящих SNP.

В пункте «Additional Resources:» выбираю опцию «The Y-DNA Haplogroup T (former K2) Project» и через пару секунд я в базе данных гаплогруппы Т. В опции «Y-DNA Results» из выпадающего списка выбираю «Сlassic» и вижу гаплотипы разной длины, принадлежащие реальным людям с гаплогруппой Т. Для других гаплогрупп алгоритм поиска такой же. Со временем вы найдёте и другие базы гаплотипов.

 

ШАГ ШЕСТОЙ

 

 Для поиска родственных связей надо сформировать матрицу гаплотипов. Для этого каждый гаплотип записывается в одну строку (проще всего это делать в формате Excel). На первом месте стоит идентификационный номер. Затем идут цифры, соответствующие выбранным маркерам. В качестве идентификационных номеров можно использовать номера KIT из базы данных или порядковый номер. Для наглядности перейдём с 67-маркерного формата в 22-маркерный. Тогда матрица будет иметь вид:

 

Labay_1.JPG.jpg

 

В следующих строках надо добавлять гаплотипы интересующих людей. В частности я заметил, что в базе данных имеется всего семь 67-маркерных гаплотипов, которые в маркере DYS492 имеют цифру 9. Запишем их 67 и 22 маркерные форматы. На первом месте стоит KIT из базы данных, в скобках идентификационный номер, который я присвоил этим гаплотипам.

64705 (идентификационный номер 2)

67 маркерный формат:

13 23 14 10 15 16 11 12 12 12 13 27 -- 17 9 9 11 13 26 14 18 33 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 16 14 17 16 38 39 12 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 11 11 13 11 11 9 11

22 маркерный формат:

11 12 13-11 13-9-11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 11 11 11 9415

168005 (идентификационный номер 3)

67 маркерный формат:

13 23 14 10 15 16 11 12 12 12 13 27 -- 17 9 9 11 13 26 14 18 33 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 16 14 17 16 39 39 13 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 8 11 13 11 11 9 11

22 маркерный формат:

11 12 13-11 13-9-11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 8 11 11 9

97388 (идентификационный номер 4)

67 маркерный формат:

13 23 14 10 15 16 11 12 12 12 13 27 -- 18 9 9 11 13 26 14 18 33 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 16 14 17 16 38 39 12 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 11 11 14 11 11 9 11

22 маркерный формат:

11 12 13-11 13-9-11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 11 11 11 9

59953 (идентификационный номер 5)

67 маркерный формат:

13 23 14 10 15 16 11 12 12 12 13 27 -- 18 9 9 11 14 26 14 18 33 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 15 14 17 16 38 39 12 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 11 11 13 11 11 9 11

22 маркерный формат:

11 12 13-11 14-9-11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 11 11 11 9

64704  (идентификационный номер 6)

67 маркерный формат:

13 23 14 10 16 16 11 12 12 12 13 27 -- 17 9 9 11 13 26 14 18 33 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 16 14 17 16 39 39 12 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 11 11 13 11 11 9 11

22 маркерный формат:416

11 1213- 11 13 – 9-11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 11 11 11 9

107555 (идентификационный номер 7)

67 маркерный формат:

13 23 14 10 16 16 11 12 12 12 13 27 -- 17 9 9 11 13 26 14 18 33 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 16 14 17 16 39 39 13 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 11 11 13 11 11 9 11

22 маркерный формат:

11 12 13-11 13-9- 11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 11 11 11 9

147827 (идентификационный номер 8)

67 маркерный формат:

13 23 14 10 16 16 11 12 12 12 13 28 -- 18 9 9 11 13 26 14 18 34 11 13 15 19 -- 10 9 22 23 16 14 17 16 38 38 11 9 -- 11 8 16 17 8 11 10 8 12 9 12 20 20 17 10 12 12 14 8 12 23 19 14 11 11 13 11 11 9 11

22 маркерный формат:

11 12 13-11 13 -9 -11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 11 11 11 9

Теперь занесём 22 маркерные гаплотипы в матрицу. Для компактности записи вместо длинных KIT я использовал нумерацию от 1 до 8. Своему гаплотипу присвоил идентификатор 1. Итого в матрице записано восемь гаплотипов.

 

Labay_2.JPG.jpg

 

Теперь видно, что гаплотипы 2, 4, 6, 7, 8  абсолютно одинаковы. Формально в ДНК-генеалогии они определяют базовый гаплотип данной популяции, который в данном случае имеет вид:

11 12 13-11 13 -9 -11 8 16 17 8 10 8 12 10 12 12 8 11 11 11 9

Предполагается, что он был у предка этой популяции. Подробнее о базовом гаплотипе можно узнать из статьи А. Клёсова « О понятиях "базовый гаплотип", "модальный гаплотип", "предковый гаплотип", «медианный гаплотип» (Вестник, т.4, номер 8, 2010г».

Возникает правомерный вопрос: «Почему тогда гаплотипы 1, 3 и 5 отличаются в некоторых маркерах друг от друга и от базового гаплотипа?»

Дело в том, что при рождении сына есть вероятность изменения любого маркера, полученного от отца. При этом обычно оказывается, что меняется в лучшем случае только один маркер, и то обычно раз во много поколений. Поэтому другие варианты имеют ничтожно малую

вероятность, которой можно пренебречь. Такие изменения в маркере называются мутациями. Многих людей это слово пугает, но бояться нечего. Во-первых, маркеры не являются генами, а значит - не влияют на генотип человека, на его здоровье и самочувствие.

Во-вторых, никто не доказал, что есть какая-то связь между состоянием маркера и какими-либо заболеваниями. Были отдельные скоропалительные заявления, но они не подтвердились.

Более подробную информацию можно получить из статьи А. Клёсова «Микросателлиты и гены Y-хромосомы» («Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии. Том 5, № 7, июль 2012»).

В чём проявляются мутации маркера?  В изменении числа, которое характеризует состояние маркера. Как это число изменяется? Оно становиться больше или меньше на 1 (одношаговая мутация). При этом направление изменения числа есть событие равновероятное, как бросание монеты в опыте «орёл-решка». Вероятность двух- или трёхшаговой мутации очень мала, но забывать о них не стоит. Как часто мутируют маркеры? Каждый маркер имеет свою вероятность мутации. У одних она выше, у других ниже. Главное не забывать, что это событие статистическое. Никто не знает,  когда оно произойдёт, но все знают, что оно произойдёт обязательно и предсказывают, что в среднем это событие произойдёт столько-то раз,  за такой-то промежуток времени. Нас не интересуют в данный момент количественные показатели этого процесса, хотя они есть. Самое главное сейчас усвоить, что из поколения в поколение в родовой популяции идёт накопление мутаций и этот процесс прямо пропорционален  времени существования этой популяции. Это означает, что в каждом роду, вместе с не мутированными гаплотипами, существуют отличные, производные от них.

 

ШАГ СЕДЬМОЙ

 

В сформированной ранее матрице мы видим следующую картину - из восьми гаплотипов пять одинаковых и три отличающихся. Загадкой остаётся только динамика развития этой популяции, то есть развитие во времени. Для решения этого вопроса необходимо провести классификацию имеющихся гаплотипов. Под классификацией (сортировкой) подразумевается система группировки гаплотипов на основе учёта общих признаков и закономерных связей между ними. Цель такой классификации это образование пучков гаплотипов (кластеров) и размещение их на некоторой шкале.

Общим в гаплотипах является структура гаплотипа и начальные условия (общий предок). Закономерным является накопление мутаций от начальных условий. И чем древнее гаплотип, тем больше можно ожидать мутаций. Правда, в силу равновероятного выбора направления мутации, накопление может тормозиться или даже «обнуляться» до начальных условий (см. статью Д.Адамова и А.Клёсова «Теоретическая и практическая оценка возвратных мутаций в  гаплотипах Y-хромосомы», Вестник Академии ДНК генеалогии, т.1, №4, 2008г.) Но при сортировке это не важно. Если гаплотипы родственные – можно ожидать скученности кластеров. А при явном разрыве – их расхождение на бОльшие расстояния на линейной шкале. Мерилом родственных отношений будет выступать, в таком случае, минимальное количество мутаций между кластерами.Прежде чем перейти к классификации (сортировке) гаплотипов, создадим матрицу расстояний, т.е. узнаем на сколько мутаций отличается каждый гаплотип друг от друга.

Для этого открываем утилиту BETA Y-DNA Comparision Utility: 111 Allele по адресу:

http://www.mymcgee.com/tools/yutility.html?mode=ftdna_mode.

Начинаем настройку интерфейса.

В строке Exists оставить включёнными только маркеры, входящие в 22-маркерный гаплотип. При работе с другими гаплотипами включается соответствующий набор.В строке Enable можно оставить все маркеры включёнными. В разделе Generate Tables :FTDNA order haplotype comprasion - выкл. SMGF order haplotype comparison with search links – выкл

Ybase order haplotype comparison – выкл

Yhrd order haplotype comparison - выкл

Genetic Distance - вкл

Hybrid mutation model - вкл

Infinite allele mutation model – выкл

В разделе General Setup:

Show Line Numbers - выкл

Create modal haplotype -выкл

Show Legends - вкл

Show Status - выкл

Show ToolTip names -выкл

Show Diagonal Count - выкл

Show HTML Source - выкл

Show Mutation Rates - выкл

В разделе Highlight Reference:

Modal Reference-выкл

Row Reference-выкл

None - вкл

ID Column - 1

1st Data Column – 2

Настройки закончены. Теперь надо скопировать данные из матрицы гаплотипов (всё, кроме первой строки) и вставить в окно Paste haplotype rows here (without marker headers). После этого нажать кнопку Execute. В новом окне сгенерируется таблица. Это и есть матрица расстояний. Нас интересуют только цифры.

 

Labay_3.JPG.jpg

 

Labay_4.JPG.jpg

 

Скопируем данные (с 3 по 10 строку) и вставим в txt. файл простейшего редактора, например «Блокнот» из стандартных программ операционных систем Windows. Все прочерки заменяем на нули. В первой строке, в крайнем правом положении, записываем цифру равную количеству гаплотипов в матрице. В нашем случае – восемь. Со второй строки записаны гаплотипы. Надо иметь в виду, что идентификаторы должны отстоять от левого крайнего положения в 10-ой позиции. Другими словами, идентификаторы должны быть десятипозиционными, не больше и не меньше. Откорректированный файл имеет вид:

 

Labay_5.JPG.jpg

 

и сохраняется как infile.txt. Это файл с входными данными для программы классификации (сортировки) гаплотипов.

 

ШАГ ВОСЬМОЙ

 

Прежде чем перейти к классификации гаплотипов, вспомним, как была сформирована выборка гаплотипов.

Во-первых, все гаплотипы принадлежат клану (гаплогруппе) Т. Во-вторых, в выборку включены только те гаплотипы, которые имеют DYS492=9. В третьих, только те гаплотипы, которые можно записать в полном 22 маркерном формате. Составив матрицу расстояний, мы выяснили:

1. На сколько мутаций отличается один гаплотип от другого.421

2. Пять гаплотипов абсолютно одинаковые.

Единственное, мы не знаем филогению 8 имеющихся гаплотипов, т.е. насколько они родственны и как шло развитие этой выборки во времени. Время связано с количеством мутаций, накопленных в каждом гаплотипе, предположительно от начальных условий. Как решить эту задачу?

Применим кластерный анализ, который не даст нам статистическую картину, но предложит наиболее возможно значимое решение. Есть множество методов иерархического кластерного анализа, которые различаются не только используемыми мерами сходства и различия, но и алгоритмами классификации. Из них наиболее распространен метод ближайшего соседа. Этот метод известен также под названием метод одиночной связи. Расстояние между двумя кластерами определяется как расстояние между ближайшими гаплотипами из этих кластеров.

На каждом шаге в матрице расстояний ищется минимальное значение, соответствующее расстоянию между двумя наиболее близкими кластерами. Найденные кластеры объединяются, образуя новый кластер. Эта процедура повторяется до тех пор, пока не будут объединены все кластеры. В нашем случае первый кластер (2,4,6,7,8), так как эти гаплотипы отличаются друг от друга на 0 ( т.е. не отличаются). Второй кластер это (1,5). Он отстоит от кластера (2,4,6,7,8) на 1. Третий кластер (3) отстоит от объединённого кластера ((2,4,6,7,8)(1,5)) на 1. Таким образом, предлагается следующее решение:

1.Гаплотипы 2,4,6,7,8 образуют базовый (предковый) гаплотип.

2.Гаплотип 3 приобретает статус самого древнего.

3. Гаплотипы 1 и 5 менее древние, но скорее всего не связаны с 3.

Существуют специальные программы, которые проводят такую классификацию самыми разными алгоритмами, отличие которых - в пересчёте расстояний, после образования новых кластеров. На сайте

http://evolution.gen...edu/phylip.html скачиваем программу PHYLIP (version 3.69). Из папки EXE копируем два файла neighbor.exe и font1 и вставляем в Новую папку (дальше можете переименовать её по своему желанию). Это будет рабочая среда классификации гаплотипов. В эту среду переносим файл infile.txt и переименовываем его в просто infile, без всякого расширения.

 

ШАГ ДЕВЯТЫЙ

 

Запускаем файл neighbor.exe . Если файл infile составлен правильно, то откроется окно:

Neighbor-Joining/UPGMA method version 3.69

Settings for this run:

 N  Neighbor-joining or UPGMA tree? Neighbor-joining

 O Outgroup root? No, use as outgroup species 1

 L Lower-triangular data matrix? No

 R Upper-triangular data matrix? No

 S  Subreplicates? No

 J  Randomize input order of species? No. Use input order

 M  Analyze multiple data sets? No

 0 Terminal type (IBM PC, ANSI, none)? ANSI

 1 Print out the data at start of run No

 2  Print indications of progress of run Yes

 3 Print out tree Yes

 4  Write out trees onto tree file? Yes

 Y to accept these or type the letter for one to change

Смело набираете “Y” и запускайте расчёт. Программа методом ближайшего соседа создаст два выходных файла: outfile и outtree. При желании их можно просмотреть в блокноте. Для нас особую ценность имеет файл outtree. Сделайте с него копию и переименуйте её в intree.

 

ШАГ ДЕСЯТЫЙ

 

Теперь нам осталось представить полученные данные в графическом виде. Для этого можно использовать модуль drawtree.exe из папки EXE. Но практика показывает, что лучше всего файл intree открывать программой Mega5 (см. http://www.megasoftware.net/). Для этого надо запустить программу. Открыть выпадающий список User Tree и выбрать опцию Edit/Draw Tree (Manual). В появившейся панели Tree Construction нажать кнопку “From A file”. Найти свой файл intree (для этого прийдётся включить опцию «Все файлы») и открыть его. Затем нажать кнопку сохранить под нужным названием в формате «.nwk». Теперь в любой момент открывайте этот файл опцией «Displey Newick Trees».

На рис.1 Изображено искомое дерево.

 

Labay_6.JPG.jpg

 

Рис. 1 Дерево из восьми 22-маркерных гаплотипов гаплогруппы Т.

Алгоритм программы работает несколько по-другому, чем стандартный алгоритм, но результат тот же. Мы видим базовый кластер 2,4,6,7,8. Кластер 5,1 здесь показан как два одиночных гаплотипа, одинаково удалённых от базового, но не связанные между собой. И одиночный гаплотип 3 – самый мутированный и значит, предположительно, самый старый из этой популяции. Такая конфигурация говорит о неоднородности выборки.

 

ШАГ ОДИННАДЦАТЫЙ

 

Что делать дальше? На этот вопрос даёт ответ статья А. Клёсова «Общие принципы ДНК-генеалогии (новая редакция)», Вестник Академии ДНК-генеалогии, том 2, номер 7, июль 2009г. Главная информация, получаемая из выборки гаплотипов - это время жизни общего предка этой популяции. Сделаем расчёт.

Из матрицы гаплотипов мы узнаем, что гаплотип №1 от базового отличается на 1 мутацию, №5 – тоже на 1 и №3 на 3 мутации. Всего – 5 мутаций на восемь гаплотипов.

Тогда имеем 5/8/0.006=104 поколения или, примерно, 104х25 ≈2600 лет назад. Точность здесь невысокая – плюс-минус 40%.

Проведенный расчёт является качественным только в том случае, если выборка гаплотипов сформирована из родственных гаплотипов. Но мы ранее определили, что выборка, скорее всего, неоднородная. Требуется проверка. Как это делается?

У нас есть пять не мутированных гаплотипов. Проведём расчет времени жизни логарифмическим способом:  (Ln(8/5))/0.006=78 поколений до общего предка. Между первым и вторым способом расхождение составляет  примерно 25%.  Можно сделать вывод, что гаплотипы в нашей выборке имеют не менее двух общих предков. Другими словами, критерий отбора  DYS492=9 не является родообразующим. Если бы расхождение было бы в пределах 5%, то выборку гаплотипов можно

было бы признать качественной. Более подробно этот вопрос изложен в статье И. Рожанского « Оценки сходимости выборок в STR-филогении и анализ ветвей дерева R1a1», Вестник Академии ДНК-генеалогии, т.3, №2, февраль 2010г.

 

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

 

Одиннадцать шагов, которые изложены в этой статье, помогут любознательному человеку быстро войти в ДНК-генеалогию. Надо понимать, что это первые шаги, алгоритм «для чайников». Но как говорят: «Да осилит дорогу идущий». А опыт – дело наживное.


  • Benuniefeks нравится это


#499 Общий Прогноз

Автор: В.Юрковец на 30 Июль 2013 - 14:21

Итак, исходя из представленных в докладе таблиц -

 

Tabl_1.jpg

 

Tabl_3.jpg

 

Tabl_3_cont.jpg

 

Tabl_4.jpg

 

Tabl_4_cont.jpg

 

- общий прогноз на ближайшие годы и десятилетия будет следующим, цитата из доклада:

 

"В ближайшие 500 лет нас ожидает усиление текущего потепления, обусловленное малым циклом. Как сказано выше, это означает разрастание пустынь за счёт степной зоны, остепение лесостепей, сдвиг границы лесной зоны к северу, сокращение климатических поясов. Падение уровня и иссушение внутренних водоёмов. Уровень Каспия, например, упадёт более, чем на 150 метров. Обмеление больших и исчезновение многих малых рек.

Совпадение во времени малого экстремума потепления с большим, обусловленным прецессионным циклом, которое также наступит через 500 лет, усилит надвигающийся экологический кризис. Такое совпадение бывает только раз в 26 тысяч лет. В предыдущее такое совпадение уровень Мирового океана за счёт таяния материковых ледников поднялся на 25 метров (онежская-каргинская-монастырская трансгрессия). Такого же подъёма следует ожидать и в текущее потепление. Ситуация начнёт меняться в сторону увлажнения только через 1500 лет.

В дальней перспективе, управляемой большим циклом, следует ожидать прохождения текущего максимума межледниковья с его окончанием и началом нового оледенения через 9 тысяч лет. Увлажнения (похолодания) и потепления внутри этого периода будут определяться малым циклом".

Прикрепленные файлы:


  • Basanda нравится это


#483 Ростов-На-Дону. V I I I Всероссийское Совещание По Изучению Четвертичного Пер...

Автор: В.Юрковец на 27 Июнь 2013 - 10:52

Результаты некоторых сопоставлений таблицы КК с археологическими и полеогеографическими данными:

 

 

В Таблице 2 показано, как коррелирует большой климатический цикл с ненарушенным (находящимся во внеледниковой области) разрезом почвенно-лёссовых отложений Западной Сибири, охватывающим период 130 тысяч лет.

 

Таблица 2. Климатические корреляции. Западная Сибирь

 

Прикрепленный файл  Tabl 2.jpg   206,79К   0 раз скачано

 

Таблица 2. Климатические корреляции. Западная Сибирь. Продолжение

 

Прикрепленный файл  Tabl 2 cont.jpg   197,94К   0 раз скачано

 

Геологический материал этой таблицы взят из обобщающей работы С.А.Архипова, посвящённой хронологии геологических событий позднего плейстоцена Западной Сибири (Архипов, 1997). Для нижней палеопочвы III террасы бердского педокомплекса верхнекраснодубровской подсвиты в работе Архипова имеется несколько радиометрических и термолюминесцентных датировок, находящихся в пределах 130 плюс-минус 10 тысяч лет, остальная часть разреза у него не датирована (за исключением голоценовой палеопочвы – 10,3 – 10, 2 тысяч лет), но стратиграфия этой области - области внеледниковых отложений, как видно из таблицы, замечательно коррелирует с прецессионным циклом. При этом лёссовые толщи соответствуют оледенениям, почвы – межледниковьям.
Всё это относится к северному полушарию, разумеется.
Как можно видеть в Таблице 2, в почвенно-лёссовом разрезе Западной Сибири, также как и на Русской равнине, выделяется Костёнковское межледниковье, которому соответствует верхняя почва II террасы искитимского педокомплекса верхнекраснодубровской подсвиты. Справа от климатических кривых в Таблице 2 (так же, как и в Таблице 1) представлена филогения и возрасты основных гаплогрупп человечества, но рассчитанные А.А.Клёсовым по самой медленной т.н. «22-маркёрной» панели (Клёсов, 2011). Специфика этой панели состоит в том, что она позволяет, не вдаваясь в детали, рассчитывать возрасты гаплогрупп на очень больших временных интервалах – десятки и сотни тысяч лет. Сопоставление данных о возрастах гаплогрупп, рассчитанных по медленной панели показывает, что периоды образования новых – эволюционных - ветвей на Филогенетическом древе Y-хромосомы напрямую связаны с глобальными климатическими изменениями. При этом образование около 65 тысяч лет назад гаплогруппы «бета» - предковой для всего неафриканского мужского населения планеты – совпадает с максимумом Ранневалдайского оледенения.
Любопытная картина получается при сопоставлении Таблицы 1 с периодами распространения мегафауны в северном полушарии – рис. 6. Это сопоставление сделано на примере распространения на Русской равнине в течение Микулинского межледниковья и Валдайского оледенения трёх видов мамонта. Материал по мамонтам взят из работы Чубура «Мамонты Верхнего Поочья: особенности популяции и связь с палеолитическим человеком».
Если взять хронологию обитания мамонта из этой работы и сопоставить её со шкалой климатических корреляций Таблицы 1, то получится, что древнейший из мамонтов – Mammuthus trogonterii chozaricus Dubrovo обитал на территории Русской равнины в микулинское межледниковье и вымер с наступлением Ранневалдайского оледенения. Следующий вид - ранняя форма продвинутого мамонта Mammuthus primigenius primigenius Blum обитал на территории Русской равнины в Костёнковское межледниковье и вымер с началом Леясциемского оледенения. Третий вид мамонта - Mammuthus primigenius primigenius Blum, поздняя форма, обитал на территории Русской равнины в Молого-Шекснинское межледниковье и вымер с началом Поздневалдайского оледенения.
Отсюда вывод – мегафауна обитала на территории севера Евразии и Северной Америки в периоды межледниковий и каждый раз вымирала с наступление очередной фазы оледенения.

 

Прикрепленный файл  Img 5.jpg   213,34К   0 раз скачано
 

Рис. 5

В Таблице 3 представлены результаты сопоставления климатических событий с археологическим данными, в основном, по Европе (Yurkovets, 2011). Для удобства климатические события, определяемые большим и малым циклом, здесь обозначены цветом. Похолодания отмечены синим фоном, потепления – жёлтым.
Как видно из таблицы, смена археологических культур и колебания уровней морей чётко коррелируют с астрономическими циклами и подчинены им.
Если говорить о большом – прецессионном цикле, то хорошо видно, что археология голоцена и позднего Валдая разительно отличаются друг от друга экологией существования древнего человека. Так, в период оледенения основными культурами Русской равнины и Западной Европы являются культуры мадлена, связные с зандровой экологией. Как пишет Сорокин, зандры с их обилием водных и биологических ресурсов в этот период становятся местом, наиболее оптимальным для жизни и привлекательным для заселения представителями древних культур (Сорокин, 1997).
В Западной и Центральной Европе такими культурами были мадлен и родственные ему гамбургская, федермессер, аренсбургская, кресвельская и свидерская культуры. В Восточной Европе - рессетинская культура. В Сибири и на Дальнем Востоке - мальтинско-афонтовская и дюктайская культуры. В Северной Америке – культура кловис.

 

Таблица 3. Археологические корреляции

 

Tabl_3.jpg


Прикрепленный файл  Tabl 3.jpg   329,8К   0 раз скачано

 

Таблица 3. Археологические корреляции. Продолжение

 

Tabl_3_cont.jpg


Прикрепленный файл  Tabl 3 cont.jpg   297,54К   0 раз скачано

 

Замечательно вписался в эту схему наиболее изученный мадлен Франции – собственно мадлен. Все шесть его подразделений идеально совпали с малым циклом внутри Поздневалдайского оледенения. Глобальное потепление восьмого тысячелетия до н.э. означало конец мадлена (в широком смысле – вместе с родственными ему культурами) как экологического феномена - как способа хозяйствования, связанного с зандровой экологией. Последние его культуры - свидерская и кундская (Пулли) в Центральной Европе, бутовская культура в Восточной Европе (Волго-Окское междуречье), кловис в Северной Америке - в это время прекращают своё существование (Юрковец, 2011).
Корреляции археологических культур с малым циклом наблюдается и в современное межледниковье. При этом всякий расцвет зоны умеренного климата, связанный с увлажнениями, служит экологической основой для очередного прыжка человечества вперёд в своём историческом развитии. И эта же зона в периоды потеплений становится зоной экологических кризисов, в разные периоды приводящих к краху очередного этапа развития человечества – «сотворению мира», «катастрофе энеолита», «катастрофе бронзового века», «великому переселению» народов» (Юрковец, 2011). В том числе и наблюдаемому в наши дни началу очередного кризиса, множественные признаки которого оформились в понятие «глобальное потепление». В периоды похолоданий и увлажнений климата всегда наблюдался расцвет цивилизации и рост численности населения Земли. Таковым было прошедшее тысячелетие.


Некоторые палеогеографические реконструкции Понто-Каспия, наложенные на климатические циклы, представлены в Таблице 4.
Сведение этих данных в таблицу несмотря на фрагментарную изученность палеогеографических событий позволяют наглядно реконструировать реакцию как мирового океана, так и внутренних водоёмов на цикличные изменения климата разгного ранга.
Так, хорошо видно, что периодичность колебаний внутренних водоёмов нашей планеты зависит только от малого климатического цикла, обусловленного совпадением перигея Луны с перигелием Земли на линии Солнце-Земля (констелляциями). Диапазон колебаний Каспийского моря, обусловленный этим циклом, составляет более 150 метров (Янина, 2009).
Периодичность колебаний Мирового океана в основном определяет большой прецессионный цикл (26000 лет), диапазон колебаний – свыше 150 метров. Но на него наложен малый климатический цикл, суперпозиция которого с большим циклом образует серию малых террас.
Что касается Чёрного моря, то оно становится внутренним водоёмом в периоды оледенений и частью Мирового океана в периоды межледниковий, что обуславливает несколько более сложный характер колебаний его уровня в разные периоды – рис 6.




Таблица 4. Палеогеографические корреляции

 

Прикрепленный файл  Tabl 4.jpg   202,04К   0 раз скачано
 

Таблица 4. Палеогеографические корреляции. Продолжение

Прикрепленный файл  Tabl 4 cont.jpg   144,69К   0 раз скачано

 

В предложенную модель хорошо вписывается схема разгрузки подпрудных вод Гросвальда.
В период трёх (возможно четырёх) тысячелетних максимумов оледенения (в позднем Валдае это было 16500?, 14500, 12500, 10500 лет назад) происходила разгрузка подпрудных вод по линии: Мансийское подпрудное ледниковое озеро – Тургай – Арал – Узбой - Каспий – Маныч – Чёрное море. Эта система на выходе аккумулировала сток основных рек Сибири – Оби, Енисея и Лены. Продолжительность таких разгрузок составляла около 1000 лет – примерно столько длилась последняя ледниковая трансгрессия Каспийского моря, которая питалась стоком именно этой системы (Гросвальд, 2009; Yurkovets, 2011). Это была сартасская трансгрессия по Матюшину и позднехвалынская трансгрессия по Яниной.


Img_6.jpg

Рис. 6

 

Внутри оледенения, в перерывах между его максимумами, мансийско-каспийский проток прекращал своё существование. Это происходило во времена кратких потеплений, обусловленных малым циклом. Климат северного полушария в эти периоды становился сухим, ледник, вероятно, несколько отступал, уровень внутренних водоёмов падал на многие десятки метров, зандровые равнины теряли источники воды и иссушались. Их материал подвергался ветровой сепарации, частично переносился воздушными потоками в зоны аккумуляции, где из него образовывались лёссовыё толщи.

 

Диаграммы и таблицы, иллюстрирующие сложное распределение террас Чёрного моря, обусловленных большим и малым циклами и образующихся в результате взаимодействия Каспия (внутренний водоём) и Средиземного моря (соединено с Мировым океаном) в разные периоды времени:

 

levels_1.jpg

 

levels_2.jpg

 

Tabl_4.jpg

 

Как сказано в  - http://dna-genealogy...цене-и-голо-r11, "...при всей несопоставимости амплитуд, колебание уровней Мирового океана и внутренних водоёмов, обусловленное малым 2000-летним циклом, происходит в противофазе. Амплитуды становятся сопоставимыми, если сравнивать колебания уровня Мирового океана, обусловленные большим циклом, и колебания уровней внутренних водоёмов, обусловленные малым циклом".


  • Леонид нравится это


#481 Ростов-На-Дону. V I I I Всероссийское Совещание По Изучению Четвертичного Пер...

Автор: В.Юрковец на 27 Июнь 2013 - 01:35

Имеет смысл открыть здесь для критики основные положения этой модели.

 

Img_2.JPG.jpg
 

Рис. 2

 

... Причиной оледенений являются два взаимосвязанных фактора – рис. 2. Первый состоит в том, что орбита, по которой Земля движется вокруг Солнца, слегка вытянута, и в перигелии – ближней к Солнцу точке орбиты – Земля в целом получает на 7% больше тепла, чем в афелии – наиболее удалённой от Солнца точке орбиты. Второй фактор заключается в том, что это тепло в течение полного цикла прецессии распределяется между двумя полушариями Земли неравномерно. Сейчас – в текущий полупериод прецессии - Земля в перигелии повёрнута к Солнцу своим южным полушарием, в афелии, соответственно, северным. Поэтому в текущий полупериод прецессии зимы в северном полушарии мягче, а лето холоднее. И наоборот – ныне зимы в южном полушарии суровее, а лето жарче. Суровость зим в южном полушарии будет нарастать ещё около 500 лет, пока проекция оси вращения Земли на плоскость эклиптики в ходе прецессии не совместится с большой осью земной орбиты. Это будет пик суровости зим в южном полушарии.
В северном – наоборот, зимы до этого события будут продолжать смягчаться.
В течение года зима на нашей планете наступает дважды – один раз в северном полушарии, второй раз в южном. Любой астрономический эффект, при прочих равных условиях понижающий температуру зимой, приведёт в целом к увеличению распространения снежного и ледового покрова в том полушарии, в котором имеет место понижение температуры. В результате из-за увеличения отражательной способности, которая у снега достигает 80%, некоторая доля лучистой энергии Солнца будет отражаться обратно в космос. Следствием этого станет увеличение продолжительности зимнего сезона, поскольку уменьшится количество солнечной радиации, поглощаемой этим полушарием. Таким образом, всякое уменьшение зимних температур включает положительную обратную связь в виде увеличивающегося альбедо, которое ещё больше понижает температуру и увеличивает продолжительность зимы.
Следовательно, включение положительной обратной связи в виде увеличения площадей с повышенным альбедо (снежным и ледяным покровом) происходит сейчас в южном полушарии. Поэтому в настоящее время в южном полушарии закономерно наблюдается оледенение, представленное ледниковым щитом Антарктиды. А в северном, соответственно, наоборот - сейчас наблюдается межледниковье.
К этому нужно добавить, что ледниковый щит Антарктиды в настоящее время занимает площадь около 14 миллионов квадратных километров. В нём сосредоточено до 90% всего льда планеты - в 10 раз больше, чем в гренландском щите. Максимальная мощность ледникового купола Антарктиды – 4800 метров, что почти в два раза превышает максимальную мощность ледниковых щитов прошедшего оледенения в северном полушарии. Большему развитию оледенения в южном полушарии препятствует отсутствие в нём суши в южной половине средних широт – там, где в северном распространены огромные пространства Евразии и Северной Америки.
Кроме того, развитие оледенения даже на относительно небольшой (по сравнению с сушей северного полушария) площади Антарктиды имеет свои ограничения. Увеличение в результате аккумуляции мощности ледового щита компенсируется ускорением гравитационного стока льда в море в виде айсбергов. По этим двум причинам сколько-нибудь существенного понижения уровня Мирового океана при оледенении в южном полушарии не происходит.

Img_3.JPG.jpg
 

Рис. 3

 

Т.о. в южном и северном полушариях оледенения сменяются межледниковьями в противофазе – когда в северном полушарии имеет место оледенение, в южном полушарии в это же время наблюдается межледниковье, и наоборот – рис. 3. В предложенную схему вписываются не только филогения основных гаплогрупп человечества, но и новейшие данные по палеогеографии Русской равнины и Западной Сибири, оледенения и межледниковья в Альпах и в Северной Америке, эвстатические колебания уровня Мирового океана, совпадающие, как известно, с чередованием оледенений и межледниковий в северном полушарии.
На климат нашей планеты серьёзное влияние оказывает ещё один астрономический фактор – констелляции орбит Земли и Луны в перигелии. Раз в 2000 лет перигей Луны и перигелий Земли находятся на одной линии с Солнцем – рис. 4. Вследствие этого происходит суммирование приливных сил Луны и Солнца с увеличением общей приливной силы на 12% относительно минимальных значений. Это приводит к возникновению в океанах внутренних волн, поднимающих к поверхности массы холодной воды, которая охлаждает и насыщает влагой атмосферные потоки. Что, в свою очередь, приводит к похолоданию и увлажнению климата Земли в целом.
Эти волны были зафиксированы в начале прошлого века шведским климатологом и океанологом Петтерсоном (Petterson, 1914) в норвежских фьордах. Вероятно, в формировании глубинных волн существенную роль играют газогидраты дна океанов (о которых тогда не знали), в обычных условиях находящиеся в равновесном состоянии (Kennett et al., 2000). При уменьшении давления, вызванного приливными силами, газогидраты начинают «шампанировать», увлекая за собой донные массы холодной воды и вызывая зафиксированные Петтерсоном последствия.

Img_4.jpg
 

Рис. 4

 

В периоды между констелляциями климат Земли в целом дрейфует в сторону аридизации и, как следствие, к климатическим кризисам в зоне умеренного климата. Климатические пояса сокращаются и смещаются к северу, за счёт степей разрастаются пустыни, лесостепи становятся степями, граница лесной зоны смещается в более высокие широты. Уровни внутренних водоёмов падают, мелеют и исчезают реки, население перебирается на более низкие террасы.
Кроме того, за счёт таяния материковых ледников несколько повышается уровень Мирового океана. Последнее означает, что при всей несопоставимости амплитуд, колебание уровней Мирового океана и внутренних водоёмов, обусловленное малым 2000-летним циклом, происходит в противофазе. Амплитуды становятся сопоставимыми, если сравнивать колебания уровня Мирового океана, обусловленные большим циклом, и колебания уровней внутренних водоёмов, обусловленные малым циклом.
Высокая климатическая контрастность 2000-летнего цикла доказана исследованиями террас внутренних водоёмов Земли (Шнитников, 1969; Матюшин, 1996). Так, диапазон колебаний Каспийского моря, обусловленные этим циклом, превышает 70 метров в голоцене и 150 метров в период последнего оледенения.
При расчётах времени жизни общего предка ветвей отдельных гаплогрупп (которые тоже имеют свои филогенетические деревья) этот 2-х тысячелетний ритм выделяется очень чётко – например, в миграциях гаплогруппы R1a, составляющей до двух третей современного населения центральной России (dna-genealogy.ru, 2013).
Схема Блитта-Сернандера и хронология увлажнений голоцена (связанных с похолоданиями) Матюшина в пределах 2-х тысячелетнего цикла также совмещаются друг с другом по принципу дополнения – каждое увлажнение (оно же похолодание) по Матюшину сменяется потеплением по Блитту-Сернандеру.
Все эти данные объединены в Таблице 1. Большой прецессионный цикл представлен в виде синусоиды с периодом 26 тысяч лет, на которую как на ось (в виде пилообразной кривой) наложен график малого 2000-летнего цикла.
Необходимо сказать, что 2000 лет для малого цикла - в этой и последующих таблицах – величина не расчётная, а эмпирическая. Она не совпадает с расчётами Петтерсона и Шнитникова. О.Петерсон, например, определил продолжительность этого цикла в 1800 лет. А.Шнитников, обобщив огромный фактический материал, выделил и описал уже 1850-летние климатические периоды послеледниковой эпохи, соответствующие космическим циклам О.Петтерсона. У Матюшина в его циклах увлажнения голоцена (УГ) эта цифра точно не определена, а пики увлажнений варьируют в пределах 1700 – 2000 лет. Однако именно в 2000-летний цикл с наименьшей погрешностью вписываются современные данные по периодизации голоцена, включая схему Блитта-Сернандера, таблицу экологических кризисов Матюшина, новейшие датировки климатических событий голоцена на Русской равнине (например, Александры Николаевны Симаковой), палеогеографические реконструкции Понто-Каспия, и – особенно - хронология археологических культур, по которой имеется самый представительный материал.
Справа от синусоиды в Таблице 1 находится подробное Филогенетическое дерево Y-хромосомы, построенное по данным Клёсова и Рожанского (Klyosov, Rozhanskii, 2012). Ещё правее – климато-литологическая колонка, включающая в себя схему Блитта-Сернандера, УГ Матюшина, возрасты ископаемых почв Русской равнины (Сычева, Гунова, Симакова, 2007; Симакова, 2008; Anikovich et al, 2007) и схему чередования оледенений и межледниковий в северном полушарии.
Данные, сведённые в эту таблицу, показывают, что кроме Молого-Шекснинского межледниковья, которому соответствуют брянская и монастырская почвы, в период Валдайского оледенения имело место ещё одно межледниковье, которое, как сказано выше, маркируют гидроузелская почва, нижняя почва Костёнок и александровская почва. Это межледниковье в таблицах обозначено рабочим названием «Костёнковское».

 

Таблица 1. Климатические корреляции

 

New_Tables_1.jpg

Прикрепленные файлы:

  • Прикрепленный файл  Tabl 1.jpg   223,4К   0 раз скачано

  • Леонид нравится это


#455 Бактрийское Царство Ариев. На Пути В Индию.

Автор: В.Юрковец на 29 Май 2013 - 10:03

В дополнение приведу уместный, на мой взгляд, комментарий к этой статье:

 

"Уважаемый автор (имеется ввиду автор статьи, процитированной уважаемым ПатРушем, В.Ю.),

Давайте почитать перед публикацией свою статью специалисту-историку. Есть вещи, на которые нужно сделать ударение. Вы конечно вроде бы правильно указали на сенсационность открытия этой цивилизации. Но вам, пишущему статью для неспециалистов следовало начать примерно так: "Долгое время считалось, что цивилизация в Средней Азии зародилась на рубеже 6-7 вв. до н.э. Но открытия, сделанные Сарианиди в 70-х гг прошлого века перевернули представления о возрасте среднеазиатской (центральноазиатской) цивилизации."

А там уже можно писать о том, что эта цивилизация стоит в одном ряду с древнейшими цивилизациями Востока.

Далее, Маргианской цивилизацией архелоги называли лишь на первых порах. Ее полное название сейчас Бактрийско-Маргианский архелогический комплекс (БМАК). Выяснилось что цивилизация не локализована одним Туркменистаном, а простиралась от Копет-дага до Памира. И располагалась на территории Южного Турменистана, Узбекистана, Таджикистана и Северного Афганистана. Тем самым потвердились смутные сведения о каком-то могущественном Бактрийском царстве, данные в более поздних источниках".


  • PatRush нравится это


#271 Тема "климатические Корреляции". Перенесена С Сайта Rodstvo.ru

Автор: Alexlong на 07 Апрель 2013 - 23:15

Валерий Павлович, я не собираюсь вступать в полемику на данном форуме по реконструкциям. Меня интересует простой вопрос Уровень каспия 11200-11100 лет назад. С остальным я дальше как нибудь попробую разобраться сам. Основополагающий (концептуальный взгляд) на начало зарождения ариев мне известен. В том числе и по сведениям изложенным в последнем номере Вестника.

В чём там у меня несуразности? У меня простой вопрос, основанный на Ваших изысканиях. Интересует Поздневалдайский период оледенения и предполагаемый уровень в промежутке 11200-11100 лет назад . Нет желания подсказать, ради бога, не надо, причём тут основополагающие сведения по пути миграций ариев, я не об этом.

Благодарю за ответ. У меня вопросов больше нет.

Ув. Славер! Не буду утомлять развернутым ответом на тему, почему "правильного" ответа гидрология не знает, а по данному вопросу имеются лишь слабо аргументированные интерпретации. Экспертная оценка устроит? Тогда искомый уровень оцениваем 25-30 БС.

Другое дело, что прорыв северных вод был (по гидробиоте), не связанный напрямую с ходом климатических изменений. Датировка такого прорыва  - "в конце Валдайского оледенения".


  • Г.З.Максименко нравится это


#1812 Сообщество "днк-Генеалогия Как Историческая Наука" В Vk

Автор: Сергец на 25 Март 2015 - 06:30

Уважаемые читатели Переформата, группе в VK ДНК-генеалогия как историческая наука в качестве эксперимента изменен статус с закрытой на открытую. Теперь каждый может посмотреть и принять решение о вступлении. По прежнему нехватает специалистов, а также открыты вакансии администраторов, модераторов (в открытой группе обязательно понадобятся, иначе придется закрыть) хотелось, чтобы это были специалисты или просто интересующиеся пользователи, знакомые с базовыми понятиями ДНК-генеалогии, одному развивать тяжело, так как очень нехватает времени.
Приглашаю всех интересующихся к участию, желающих присоединиться к администрации группы прошу писать в личку.http://vk.com/club86388164
  • Сергец нравится это


#1350 Определение Своего Рода

Автор: В.Юрковец на 22 Июнь 2014 - 19:54

Здравствуйте, Денис! Благодарю Вас за добрые слова.

 

Основной ответ на Ваш вопрос Вы найдёте в специально открытой теме - http://dna-genealogy...-и-гаплогруппу/

 

К изложенному там следует добавить, что в ближайшее время определить свой гаплотип и гаплогруппу можно будет в России, в Москве. Вся необходимая научная и материальная база уже создана. Имеется помещение, лаборатория и персонал. Дело осталось за малым - регистрацией Академии ДНК-генеалогии в России. К сожалению, бюрократические процедуры оказались самыми трудоёмкими. Следите за новостями - как только завершится регистрация, наша лаборатория начнёт принимать биологический материал для определения гаплогруппы и гаплотипа.


  • Денис нравится это


Copyright © 2017 Академия ДНК-генеалогии. Климатический филиал