Перейти к содержимому

 

Фото

Новый Калькулятор Для Для Расчёта Времени Жизни Общего Предка


  • Чтобы отвечать, сперва войдите на форум
7 ответов в теме

#1 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 532 сообщений

Опубликовано 06 Август 2014 - 05:46

В.В.Килин и А.А.Клёсов разработали принципиально новый калькулятор расчёта времен до общих предков серий гаплотипов во всем диапазоне от сотен до миллионов лет назад, основанный на модели случайных блужданий. Статья на эту тему размещена в мартовском номере Вестника на стр.438-478.
Калькулятор можно скачать по ссылкам:

aklyosov.home.comcast.net/Kilin-Klyosov TMRCA 111 ver 1.xlsb

aklyosov.home.comcast.net/Kilin-Klyosov TMRCA 67 ver. 1.xlsb

aklyosov.home.comcast.net/Kilin-Klyosov TMRCA 22 ver 1.xlsb

aklyosov.home.comcast.net/Kilin-Klyosov TMRCA Y filer ver 1.xlsb

Ссылки неактивные. Их надо копировать в браузер. Для открытия файлов нужен Excel, поддерживающий расширение .xlsb .

Калькулятор для 111-маркерных гаплотипов универсальный, позволяет работать с любыми гаплотипами. В 4 и 5 номерах Вестника А.А.Клёсов делится опытом применения этого калькулятара для расчетов TMRCA по разным сериям гаплотипов.



#2 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 532 сообщений

Опубликовано 06 Август 2014 - 06:18

Ниже, из статьи А.Клёсова ( 4 номер Вестника за 2014) приведены:


ПРИНЦИПИАЛЬНЫЕ ОСОБЕННОСТИ РАБОТЫ КАЛЬКУЛЯТОРА
1. Расчеты линейным методом (вручную, используя кумулятивные
константы скорости мутации для целых гаплотипов) и на
калькуляторе принципиально различаются. Кумулятивные
константы скоростей не делают разницы между «быстрыми» и
«медленными» маркерами, все мутации суммируются. То же
относится и к поправкам на возвратные мутации, они
усредненные, по «медленным» и «быстрым» мутациям. Поэтому в
некоторых случаях результаты расчетов могут различаться в
«ручном» виде и по калькулятору. Особенно это видно при
мутациях в «медленных» маркерах в сериях из нескольких
гаплотипов.
2. Калькулятор в идеальном случае может применяться только при
расчете сотен и тысяч гаплотипов.
3. Калькулятор практически неприменим при расчете ТМRСА
только для нескольких гаплотипов, и тем более для двух
случайных гаплотипов.
4. Для правильных расчетов нужно предварительно разделять
принципиальные ветви в наборах гаплотипов.
5. Нужно каждый раз внимательно смотреть на показатели
дисперсии и отношения величин TMRCA к среднему по каждому
маркеру (две нижних строки верхней панели) , и делать выводы о
достоверности расчета. Иначе говоря, с калькулятором нужно
работать, а не просто снимать цифру TMRCA в верхнем левом
углу.
6. В ряде случаев целесообразно менять лимитирующие показатели
расчета (верхние числа в колонках E и F). Они меняют верхний
предел ограничений на дисперсию аллелей и на отношение
TMRCA по каждому маркеру к средней величине по всем
маркерам. Пояснения – в тексте этой статьи. Но такие замены
должны быть обоснованы, и их стоит избегать, чтобы не вносить
произвол в расчеты.
7. Для малых серий предпочтительно считать вручную, линейным
методом. Другими словами, калькулятор имеет смысл применять
только тогда, когда вручную считать практически невозможно –
или при очень массивных сериях гаплотипов, из сотен и тысяч
единиц, или при исключительно древних общих предках, сотни
тысяч лет назад, когда поправка на возвратные мутации
становится нестабильной и ненадежной.

#3 В.Юрковец

В.Юрковец

    Advanced Member

  • Administrators
  • 1 347 сообщений

Опубликовано 06 Август 2014 - 20:11

Приветствую, Александр Анатольевич!

 

Спасибо, что растолковали суть нового метода и очертили границы его применимости. Вот только ссылки на калькулятор у меня не открываются. На всех стандартный ответ "Sorry, the page you were looking for could not be found".



#4 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 532 сообщений

Опубликовано 07 Август 2014 - 07:09

Действительно! И у меня перестали открываться. Но скачивал калькуляторы по этим ссылкам. Да и А.Клёсов в указаных статьях даёт эти ссылки. Зашёл на его домашнюю страницу и не нашёл раздела Килин-Клёсов. Странно! Попробую обратиться к автору на прямую.

#5 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 532 сообщений

Опубликовано 09 Август 2014 - 10:51

Лучше всего пользоваться неактивными ссылками. Я их вставил в первое сообщение. Оттуда их надо скопировать и вставить в браузер. Иногда с первого раза не получается, но если набраться терпения, то рано или поздно они открываются.

#6 Лабай А.А.

Лабай А.А.

    Advanced Member

  • Members
  • PipPipPip
  • 532 сообщений

Опубликовано 22 Август 2015 - 10:26

Новая улучшенная версия  калькулятора:

http://aklyosov.home...t/Kilin-KlyosovTemplate TMRCA 111 ver 2.xlsx



#7 Guest_unprincipled_*

Guest_unprincipled_*
  • Guests

Опубликовано 21 Сентябрь 2017 - 16:57

Эти калькуляторы на сколько точны?

восстановление зренияm34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34
m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34m34



#8 В.Юрковец

В.Юрковец

    Advanced Member

  • Administrators
  • 1 347 сообщений

Опубликовано 21 Сентябрь 2017 - 21:56

Что Вас интересует, уважаемый ... (не знаю как к Вам обратиться, "беспринципный" как-то неудобно), математика или всего лишь степень доверия обывателя к результатам? Если первое - обратитесь к соответствующим темам на этом форуме. Если второе - достаточно точны для того, чтобы делать надёжные выводы, касающиеся истории миграций древних родов, их связи с археологическими культурами и, в целом, истории человечества.






1 пользователей читают эту тему

0 пользователей, 1 гостей, 0 скрытых

Copyright © 2020 Академия ДНК-генеалогии. Климатический филиал